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亚洲色站导航 值得保藏!一文带你全方向了解双分子荧光互补(BiFC)技艺(上篇)

发布日期:2024-11-04 06:27    点击次数:85
卵白质是人命体的迫切组成部分,是人命步履的主要承担者和扩充者。据揣度,跨越80%的卵白质并不是孑然存在,而是与其他卵白质通过相互作用造成瓦解或瞬时的复合物结构。卵白质-卵白质相互作用(protein-protein interactions,PPIs)是分子生物学中最迫切的局势之一,险些在统共的人命历程如信号转导、细胞通信、代谢、转运、免疫应付和基因转录中王人起着关节作用。因此,连系卵白质-卵白质相互作用关于发达卵白质分子的生物功能以及分子作用机理具有迫切的真谛。

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鉴于卵白质-卵白质相互作用(PPIs)在人命步履中的中枢性位,潜入探索其细节与动态历程已成为科研东谈主员的不懈追求。在繁密连系行动中,双分子荧光互补(Bimolecular Fluorescence Complementation, BiFC)技艺行为一种直不雅且浩大的器用,频年来在PPIs连系中崭露头角。其旨趣是将荧光卵白切开分为N-和C-两个片断,分别与待考证的两个卵白A和B和会抒发,要是卵白A和B能够接近发生互作,那么荧光卵白片断N-和C-也会随着一谈网络并重新组成齐全的有活性的卵白,从而发出荧光。

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金开瑞使用的是YFP荧光卵白的变体Venus,其荧光强且布景敏锐度低,将其分为了N端173个氨基酸和C端155个氨基酸,两个载体以VN173和VC155暗意。两个待测卵白分别网络到VN173和VC155载体上,在转动农杆菌并打针香烟后进行检测。操作设施如下所述:01.基因合成及载体构建●A基因模板构建到VC155-21OV303_pC2300-mVYCE载体上测序考证(带有HA标签);●B基因模板构建到VN173-21OV302_pC1300-mVYNE载体中测序考证(带有myc标签)。02.质粒转动及香烟打针●栽培本氏香烟(Nicotiana benthamiana):将萌生的本氏香烟(Nicotiana benthamiana)在16 h光照/8 h暗淡,温度28℃,相对湿度70%要求下培养能够4~5周●对合成好的载体进行农杆菌转动GV3101(pSoup-p19)●挑取含有主义载体的农杆菌单克隆,在含有10 mL相应抗生素(K+Rif+)的LB液体培养基中扩大培养,能够培养36h~48h●室温,7000 rpm离心2 min网罗菌体,用MES缓冲液(10mL)清洗菌液一次,加入5 mL的MES缓冲液,取稀释十倍的菌液测量OD600的值,调度OD600为1.2~1.6(1.4)阁下,等体积羼杂两种菌液,加入乙酰丁香酮至终浓度为150 μM。摇菌1~1.5h●诡计公式:➢羼杂菌:1.4*摇菌体积=OD值*菌体积*10➢单菌:0.7*摇菌体积=OD值*菌体积*10●中式滋长期为1个月阁下十足伸展的香烟叶片,将羼杂好的菌液用1 mL打针器(去掉针头)从香烟叶后面进行打针●室温避光培养36~48h后在激光共聚焦下拍照●菌液组合如下表:

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03.实验请托

(1)返还主义基因剩余质粒;

(2)默许作念1个阳性对照,3个阴性对照,1个实验组,共5组;

(3)1组阳性对照和3组阴性对照各请托1个视线,实验组请托4-5个视线,每个视线王人包含YFP、Bright field、Merge 3张图;

(4)结题证实以及全部原始数据。

04.结果解读

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(1)默许分组形貌如图所示,每组每个视线王人会拍摄荧光、明场以及和会3张像片;

(2)“YN173-P1 + YC155-P2”为阳性对照,“P1”和“P2”是已知能够互作的卵白,我司使用SPX4卵白行为阳性对照,该卵白能够与自己造成二聚体 (引自:DOI: 10.1105/tpc.114.123208);(3)“YN173 + YC155”为阴性对照,转染的一双空载质粒,不会检测到荧光;(4)“YN173-A + YC155-B”为实验组,“A”和“B”指代待考证是否互作的一双卵白,在阴阳性对照平时的情况下,要是实验组能检测到荧光,讲解两个卵白能够互作,反之讲解两个卵白不行互作;(5)“YN173-A + YC155”和“YN173 + YC155-B”为单分子对照组,同阴性对照不会检测到荧光;(6)由于和会抒发卵白空间构象的问题,巧合在莫得检测到互作的情况下,疏通两个卵白的BiFC载体重新考证,又能够检测到互作。05.选藏事项

(1)荧光卵白片断的礼聘与考证:确保所选荧光卵白片断(如GFP的N端和C端)在单独抒发时不产生荧光,幸免假阳性;

(2)和会卵白的抒发:考证和会卵白(筹画卵白与荧光卵白片断的和会)在细胞中的正确抒发和定位;

(3)转染结果优化:调度转染要求以拔擢筹画细胞内的和会卵白抒发水平,同期减少细胞毒性;

(4)时候放置:精准放置荧光卵白抒发的时候窗口,确保在细胞生理气象下不雅察PPIs;

(5)荧光不雅察与成像:使用妥贴的显微镜和成像确立,了了捕捉荧光信号,分袂确凿信号与布景噪声;

(6)对照实验:设立明确的阴性和阳性对照,以分袂非特异性伙同和确凿PPIs;

(7)实验要求一致性:保合手每次实验要求(如细胞类型、培养要求、成像参数等)的一致性,以便于结果相比。

调教06.常见问题与解答Q怎么确保BiFC实验中检测到的荧光信号响应的是确凿的卵白质相互作用?A

为了确保荧光信号的确凿性,需要排斥假阳性的可能性。假阳性可能是由于荧光卵白片断的非特异性相互作用或其他非筹画卵白质之间的相互作用引起的。因此,在实验中应确立对照组,如单独抒发荧光卵白片断或筹画卵白的对照组,以排斥非特异性相互作用的侵略。此外,还不错伙同其他实验行动,如免疫共千里淀(Co-IP)、共定位、酵母杂交等,来进一步考证卵白质相互作用。

 

QBiFC实验中检测到的荧光信号较弱,怎么优化?A

荧光信号较弱可能是由于荧光卵白片断与筹画卵白的和会结果不高,或者和会卵白在细胞内的抒发量较低。为了优化荧光信号,不错尝试增强运行子,以拔擢和会卵白的抒发水平。此外,还不错优化转染要求,确保细胞具有较高的转染结果。在制片历程中,应尽可能清算干净叶片名义的杂质,排斥气泡,以减少布景侵略。

 

QBiFC实验中莫得检测到荧光信号,可能的原因是什么?A

可能的原因有多种。领先,可能是所连系的卵白质之间确乎不存在相互作用,因此无法造成齐全的荧光卵白。其次,可能是荧光卵白片断与筹画卵白的和会构建存在问题,导致和会卵白不行正确抒发或折叠。此外,实验要求、细胞气象或转染结果等身分也可能影响荧光信号的检测。针对这种情况,提议重迭实验,优化实验要求,并查验和会卵白的抒发情况。

07.写稿参考

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篇幅有限,本期小金先先容到这里,下期咱们再一谈商量双分子荧光互补(BiFC)技艺在不同物种践诺连系中的具体诈欺,敬请期待!



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